More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0103 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0103  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
129 aa  258  1e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0143  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
129 aa  258  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000440039  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  93.8 
 
 
129 aa  246  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0001138  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  71.2 
 
 
130 aa  188  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00211971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.1 
 
 
129 aa  142  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.28 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1524  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.23 
 
 
129 aa  135  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000172904  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  51.59 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0688  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.22 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00189916  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1402  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
130 aa  116  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.4 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.72 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.76 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.13 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.36 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.41 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  31.78 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.48 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.65 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.5 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.98 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0505  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.17 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.250005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.91 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.35 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.48 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.35 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.27 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5126  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  37.04 
 
 
81 aa  62  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285472  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.09 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.36 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.23 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.64 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.67 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.06 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0047  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  41.03 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.51 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.32 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.25 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.29 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.64 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.24 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3525  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.56 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.56 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.56 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.56 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.13 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.48 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.56 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1800  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.57 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.502028  normal  0.0883001 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.56 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.9 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.01 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.68 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.58 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.14 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0907989  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  32.1 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.9 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.09 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3416  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  38.75 
 
 
80 aa  58.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.93 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2015  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.33 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1532  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.32 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.7 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.33 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0810  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.23 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116067  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.25 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.65 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.34 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.78 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21390  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  40 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.66 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.63 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0048  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  35.9 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4746  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.66 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.63 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3764  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  42.5 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.56 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.1 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.65 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.41 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.34 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>