More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2381 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
137 aa  275  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.85 
 
 
132 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.08 
 
 
132 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  51.18 
 
 
139 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.41 
 
 
134 aa  120  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.38 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.44 
 
 
134 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.61 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.85 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.44 
 
 
140 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.98 
 
 
134 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2843  ATP synthase F1, epsilon subunit  44 
 
 
141 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  42.31 
 
 
142 aa  104  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.85 
 
 
133 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.03 
 
 
139 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.96 
 
 
137 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.88 
 
 
134 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  46.09 
 
 
137 aa  100  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.86 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.23 
 
 
133 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.12 
 
 
142 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.23 
 
 
133 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.23 
 
 
133 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.23 
 
 
133 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.23 
 
 
133 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
133 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
133 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
133 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
133 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  46.3 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.52 
 
 
138 aa  97.1  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.6 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.69 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.86 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.53 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.22 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.15 
 
 
134 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.15 
 
 
134 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.69 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.31 
 
 
140 aa  90.5  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.35 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.57 
 
 
140 aa  89.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1708  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.91 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.31 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.59 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.82 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  35.82 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.71 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.71 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.15 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.15 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2451  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2161  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.15 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.98 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  36.64 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
137 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
137 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.41 
 
 
134 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
139 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
139 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
137 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.58 
 
 
141 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
139 aa  84  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.38 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.82 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.44 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.82 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  35.38 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.38 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.82 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.58 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.58 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.58 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.58 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.58 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.58 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.43 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.94 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.61 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4044  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.58 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0607  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.06 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.444989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.8 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1932  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.59 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>