More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4264 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
138 aa  274  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  88.41 
 
 
138 aa  246  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  87.68 
 
 
138 aa  244  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  86.96 
 
 
138 aa  239  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  84.06 
 
 
138 aa  230  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  79.71 
 
 
138 aa  228  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1508  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  68.84 
 
 
138 aa  202  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0607  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  69.57 
 
 
138 aa  201  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.444989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.85 
 
 
138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.12 
 
 
138 aa  168  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.15 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  51.49 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  44.2 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.85 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.45 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.53 
 
 
138 aa  107  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.27 
 
 
142 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.29 
 
 
136 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.38 
 
 
134 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.54 
 
 
132 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.75 
 
 
133 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.41 
 
 
140 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.18 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.75 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.7 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.55 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.19 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.64 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.98 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.34 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.96 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.96 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.74 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.64 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.64 
 
 
133 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.64 
 
 
133 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.64 
 
 
133 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.64 
 
 
133 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.7 
 
 
140 aa  87  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.64 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.91 
 
 
134 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.91 
 
 
133 aa  83.6  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.44 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.69 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.69 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.72 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  36.64 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.82 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.52 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2843  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.12 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.62 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.02 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.81 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.09 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.76 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1237  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.59 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.36 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.01 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.96 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.92 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.45 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.82 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.81 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.45 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.45 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16411  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.33 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.662603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1708  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.88 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.83 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16181  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.96 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1932  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.53 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.11 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.61 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1532  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.31 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.77 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.61 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.61 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.51 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.73 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.09 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.09 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.1 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.85 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  34.85 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.71 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>