More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0468 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
143 aa  290  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1237  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.53 
 
 
146 aa  122  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.11 
 
 
148 aa  120  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.12 
 
 
137 aa  110  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.03 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
133 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.79 
 
 
133 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
133 aa  103  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1932  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.14 
 
 
141 aa  103  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.3 
 
 
134 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.3 
 
 
134 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0666  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  48.62 
 
 
142 aa  101  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.177829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.27 
 
 
134 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1708  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.15 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239436  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0522  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.07 
 
 
148 aa  95.1  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.508742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  40 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.69 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.03 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.88 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.72 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.82 
 
 
132 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.34 
 
 
132 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.34 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2843  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.76 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.82 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.39 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0744  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.11 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.61 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.78 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  29.63 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.81 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.53 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.63 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.09 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2161  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.3 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.94 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.37 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0204  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.41 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2451  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.3 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.07 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.01 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  35.56 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.43 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  31.16 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.11 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.6 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.06 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.22 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4617  ATP synthase F1, epsilon subunit  40 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.66 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.71 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4044  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.85 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757579  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  28.36 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.79 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.79 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.79 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.79 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.79 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.78 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.79 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.78 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.78 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.5 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.78 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.78 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.78 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.79 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.45 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.1 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.91 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.41 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.06 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.31 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0901  ATP synthase F1 subunit epsilon  33.96 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.20439  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4134  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.88 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.95 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0758  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  26.43 
 
 
171 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.61 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.35 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3751  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.63 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000167376  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.91 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5017  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.32 
 
 
138 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.35 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.35 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.35 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.35 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.35 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.35 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.35 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>