More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0098 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  99.29 
 
 
141 aa  275  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  93.62 
 
 
141 aa  261  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  93.62 
 
 
141 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  93.62 
 
 
141 aa  261  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  93.62 
 
 
141 aa  261  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  93.62 
 
 
141 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  93.62 
 
 
141 aa  261  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  93.62 
 
 
141 aa  261  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  94.33 
 
 
141 aa  261  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  83.69 
 
 
141 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  83.69 
 
 
141 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  82.27 
 
 
141 aa  229  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  78.26 
 
 
137 aa  205  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  71.01 
 
 
138 aa  197  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  81.67 
 
 
138 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  81.67 
 
 
138 aa  191  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  80.83 
 
 
138 aa  191  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  80 
 
 
138 aa  190  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  70.37 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  76.86 
 
 
138 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  67.91 
 
 
138 aa  184  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0907989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  71.01 
 
 
138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0959525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  71.01 
 
 
138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.799769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0373  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  70.29 
 
 
138 aa  178  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  75 
 
 
139 aa  178  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0256  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  72.39 
 
 
138 aa  176  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  70.9 
 
 
138 aa  176  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  73.55 
 
 
138 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0328  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  71.64 
 
 
138 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0198  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  72.99 
 
 
138 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3525  ATP synthase F1, epsilon subunit  79.63 
 
 
125 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012932 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.82 
 
 
141 aa  164  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.82 
 
 
140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.35 
 
 
139 aa  160  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  57.35 
 
 
140 aa  159  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.09 
 
 
140 aa  157  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.25 
 
 
140 aa  156  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.41 
 
 
140 aa  156  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.22 
 
 
139 aa  155  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  55.22 
 
 
139 aa  155  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.22 
 
 
139 aa  155  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.22 
 
 
139 aa  155  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.22 
 
 
139 aa  155  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  55.22 
 
 
139 aa  155  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.22 
 
 
139 aa  155  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.22 
 
 
139 aa  155  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.48 
 
 
137 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.48 
 
 
137 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.38 
 
 
139 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2586  ATP synthase F1, epsilon subunit  60.15 
 
 
139 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0602352 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.38 
 
 
139 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.48 
 
 
137 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.48 
 
 
139 aa  154  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.48 
 
 
139 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4603  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.42 
 
 
139 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359837  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4469  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.42 
 
 
139 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0365154  normal  0.135413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  54.48 
 
 
139 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  61.48 
 
 
141 aa  150  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.968865  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.01 
 
 
141 aa  150  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  56.72 
 
 
140 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.08 
 
 
139 aa  150  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  53.85 
 
 
140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.62 
 
 
139 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.54 
 
 
139 aa  148  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.07 
 
 
141 aa  147  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  51.54 
 
 
140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.31 
 
 
140 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.31 
 
 
140 aa  144  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.31 
 
 
140 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0810  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.58 
 
 
139 aa  143  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116067  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.43 
 
 
138 aa  141  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.87 
 
 
138 aa  140  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.87 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.47 
 
 
140 aa  136  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  49.24 
 
 
139 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0484  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.26 
 
 
143 aa  133  8e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0423  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.26 
 
 
143 aa  133  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.73 
 
 
137 aa  133  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0140  ATP synthase F1, epsilon subunit  46.32 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0174  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.48 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.48 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4364  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 
142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.788281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 
142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4506  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 
142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.107248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4365  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
142 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4746  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.65 
 
 
142 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.15 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  51.49 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4044  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.48 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3924  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.52 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0244651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.52 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4129  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.52 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.734658  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.06 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.93 
 
 
142 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>