More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0511 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
139 aa  269  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.808616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  97.84 
 
 
139 aa  240  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  70.59 
 
 
136 aa  191  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  77.21 
 
 
139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  58.91 
 
 
140 aa  140  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
132 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.25 
 
 
140 aa  120  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.19 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.24 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  50.78 
 
 
134 aa  113  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.83 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.38 
 
 
133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  47.1 
 
 
140 aa  110  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.54 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.78 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.78 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.78 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  44.78 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.78 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.78 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.78 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.78 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.03 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  44.88 
 
 
142 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.03 
 
 
139 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.61 
 
 
139 aa  104  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.03 
 
 
137 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.03 
 
 
139 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.03 
 
 
137 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.03 
 
 
139 aa  104  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.03 
 
 
139 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.03 
 
 
137 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.71 
 
 
134 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.2 
 
 
141 aa  103  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  49.24 
 
 
140 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  49.22 
 
 
139 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.28 
 
 
139 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.28 
 
 
139 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.28 
 
 
140 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  40.15 
 
 
140 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.28 
 
 
139 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.28 
 
 
140 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.88 
 
 
141 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.88 
 
 
140 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.51 
 
 
134 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.42 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.96 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.19 
 
 
133 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.54 
 
 
142 aa  99  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.44 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.54 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.54 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.54 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.06 
 
 
133 aa  97.1  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.75 
 
 
138 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.69 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.42 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.04 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.69 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0907989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.28 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.28 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.28 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.28 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.28 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.28 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.51 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.28 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.28 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.28 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.22 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.48 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.48 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.48 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.48 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.48 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.48 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.48 
 
 
141 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.29 
 
 
139 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.5 
 
 
133 aa  93.6  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.94 
 
 
137 aa  93.6  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.64 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3202  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.6 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.447549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.75 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2806  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.6 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.668633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.75 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.97 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.08 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.98 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0174  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.08 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.75 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.75 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2843  ATP synthase F1, epsilon subunit  45 
 
 
141 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.74 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.69 
 
 
137 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.87 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2586  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.73 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0602352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.96 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.41 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.88 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>