More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2806 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2806  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.668633 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3202  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
141 aa  277  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.447549  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55 
 
 
141 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  54.35 
 
 
140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.74 
 
 
141 aa  142  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.4 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.968865  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.82 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.28 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2586  ATP synthase F1, epsilon subunit  53.96 
 
 
139 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0602352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.8 
 
 
140 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.63 
 
 
139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.22 
 
 
141 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.48 
 
 
141 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.48 
 
 
141 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.88 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0174  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.45 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.45 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.91 
 
 
139 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  52.17 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.83 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.24 
 
 
137 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.52 
 
 
141 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.52 
 
 
141 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.52 
 
 
141 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.52 
 
 
141 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.52 
 
 
141 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.52 
 
 
141 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.52 
 
 
141 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.83 
 
 
139 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.65 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  52.55 
 
 
140 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.91 
 
 
139 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2164  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.45 
 
 
144 aa  125  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.51 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.51 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.91 
 
 
139 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.76 
 
 
141 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.59 
 
 
140 aa  124  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 
139 aa  123  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  46.38 
 
 
139 aa  123  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 
139 aa  123  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 
139 aa  123  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  46.38 
 
 
139 aa  123  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 
139 aa  123  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 
139 aa  123  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 
139 aa  123  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.37 
 
 
140 aa  123  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.59 
 
 
140 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.59 
 
 
140 aa  123  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.59 
 
 
140 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.76 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.76 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.76 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.76 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.76 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.76 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.76 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.18 
 
 
139 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.96 
 
 
138 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.14 
 
 
138 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.62 
 
 
139 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.67 
 
 
138 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.18 
 
 
139 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.73 
 
 
137 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.73 
 
 
137 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.73 
 
 
137 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
139 aa  120  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.89 
 
 
140 aa  120  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5120  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.55 
 
 
141 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.3 
 
 
138 aa  120  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.79 
 
 
138 aa  120  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.96 
 
 
138 aa  120  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.37 
 
 
138 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.79 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0907989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5598  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.79 
 
 
139 aa  116  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0423  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.27 
 
 
143 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1742  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  46.81 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.340723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.62 
 
 
138 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0484  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.27 
 
 
143 aa  115  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0198  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.74 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0758  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  45.59 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.62 
 
 
138 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0904  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.78 
 
 
171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.112177  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3525  ATP synthase F1, epsilon subunit  48.39 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.38 
 
 
140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2423  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  45.86 
 
 
163 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.72522  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2053  ATP synthase F1, epsilon subunit  45.86 
 
 
163 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.376983  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6355  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.55 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73230  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.55 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  43.07 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.46 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.15 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0959525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5729  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337873  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.48 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.15 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.799769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.38 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.46 
 
 
140 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0373  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.26 
 
 
138 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.48 
 
 
141 aa  110  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>