More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5598 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5598  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5120  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  99.28 
 
 
141 aa  278  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  88.89 
 
 
139 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  88.89 
 
 
139 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  87.41 
 
 
139 aa  224  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  86.67 
 
 
139 aa  223  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5729  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  92.09 
 
 
141 aa  214  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337873  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  77.54 
 
 
140 aa  214  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6355  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  86.33 
 
 
141 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73230  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  86.33 
 
 
141 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4606  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  79.86 
 
 
144 aa  201  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  62.04 
 
 
140 aa  167  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  56.62 
 
 
139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  58.7 
 
 
140 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0174  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.22 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.22 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.07 
 
 
142 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  52.59 
 
 
139 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.52 
 
 
137 aa  149  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.33 
 
 
139 aa  148  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  60.74 
 
 
141 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.47 
 
 
142 aa  147  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.01 
 
 
142 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  52.59 
 
 
140 aa  146  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4506  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.01 
 
 
142 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.107248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4364  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.01 
 
 
142 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.788281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.33 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4365  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.01 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.93 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.33 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  53.33 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.33 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.33 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.09 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.33 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  53.33 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.33 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.85 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.33 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.21 
 
 
141 aa  143  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  51.85 
 
 
140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.59 
 
 
137 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.59 
 
 
137 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.59 
 
 
139 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4746  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.28 
 
 
142 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.85 
 
 
140 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.85 
 
 
140 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.07 
 
 
141 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.59 
 
 
139 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3924  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.28 
 
 
142 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0244651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.28 
 
 
142 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.68 
 
 
141 aa  142  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.85 
 
 
140 aa  142  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4129  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.28 
 
 
142 aa  142  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.734658  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.59 
 
 
137 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.59 
 
 
139 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.59 
 
 
139 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.62 
 
 
141 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.968865  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4485  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.47 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  hitchhiker  0.00000768605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3965  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  62.04 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000264026  normal  0.273139 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3052  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.66 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.82 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.47 
 
 
140 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2909  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  56.93 
 
 
140 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3844  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.74 
 
 
142 aa  137  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.64 
 
 
141 aa  135  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.37 
 
 
138 aa  135  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3751  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.09 
 
 
142 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000167376  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.64 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.91 
 
 
141 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.53 
 
 
140 aa  133  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.89 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4239  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.55 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.785039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.12 
 
 
139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4044  ATP synthase F1, epsilon subunit  50 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2586  ATP synthase F1, epsilon subunit  49.64 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0602352 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  54.81 
 
 
140 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.37 
 
 
137 aa  130  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.89 
 
 
138 aa  130  9e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  44.85 
 
 
140 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.59 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  51.85 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.74 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.59 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0423  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.19 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0484  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.72 
 
 
141 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0140  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.76 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
141 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
141 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
141 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
141 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
141 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
141 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.01 
 
 
141 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.99 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.99 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.67 
 
 
138 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0907989  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.99 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>