More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0904 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0904  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
171 aa  349  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.112177  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0758  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  97.66 
 
 
171 aa  341  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2053  ATP synthase F1, epsilon subunit  96.93 
 
 
163 aa  323  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.376983  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2423  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  96.93 
 
 
163 aa  323  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.72522  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
141 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.42 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.42 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.42 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.42 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.42 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.42 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.42 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
141 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
141 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
141 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
141 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
141 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
141 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.11 
 
 
141 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0311  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.67 
 
 
139 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31293  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2806  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.78 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.668633 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3202  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.78 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.447549  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.15 
 
 
141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.52 
 
 
141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  38.64 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.39 
 
 
141 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0421  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
138 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.23 
 
 
141 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.81 
 
 
138 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0907989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.55 
 
 
138 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.799769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.55 
 
 
138 aa  104  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0959525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.35 
 
 
141 aa  104  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.81 
 
 
140 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.18 
 
 
138 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.18 
 
 
138 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.3 
 
 
138 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1742  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  39.71 
 
 
141 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.340723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3493  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.34 
 
 
138 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000220298  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.55 
 
 
137 aa  101  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3345  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.18 
 
 
138 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00950448  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0373  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.06 
 
 
138 aa  100  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.81 
 
 
138 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0484  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.41 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0423  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.41 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.22 
 
 
139 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
139 aa  97.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
139 aa  97.4  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
139 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4603  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.88 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359837  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4115  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.15 
 
 
141 aa  97.1  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.968865  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0256  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.57 
 
 
138 aa  97.1  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.344579  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
139 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.81 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06103  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.71 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0174  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
142 aa  97.1  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2586  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.1 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0602352 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.85 
 
 
142 aa  97.1  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.01 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4469  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.88 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0365154  normal  0.135413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0328  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
138 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.531135 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
140 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
140 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
140 aa  95.5  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.65 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.43 
 
 
140 aa  94.4  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.31 
 
 
142 aa  94.4  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
139 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.43 
 
 
139 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
139 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
139 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
139 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
139 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
139 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  35.43 
 
 
139 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.06 
 
 
139 aa  94  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0198  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.67 
 
 
138 aa  93.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40 
 
 
138 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.187642  hitchhiker  0.000120688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.07 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3052  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.01 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2909  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.01 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3525  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.2 
 
 
125 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.012932 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.33 
 
 
138 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.92 
 
 
139 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5199  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.91 
 
 
139 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5412  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.92 
 
 
139 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5430  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.92 
 
 
139 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52150  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.85 
 
 
140 aa  91.3  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.32 
 
 
140 aa  91.7  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.09 
 
 
139 aa  91.3  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  35.43 
 
 
140 aa  91.7  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.43 
 
 
140 aa  91.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5412  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.58 
 
 
152 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782662 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.65 
 
 
139 aa  91.3  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3492  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.91 
 
 
152 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0175018  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.88 
 
 
141 aa  90.9  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.57 
 
 
140 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>