More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0264 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
139 aa  276  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  93.48 
 
 
151 aa  257  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  87.41 
 
 
135 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  79.26 
 
 
135 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  77.78 
 
 
135 aa  213  8e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  73.33 
 
 
135 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  73.33 
 
 
135 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.62 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  46.83 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.35 
 
 
133 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.11 
 
 
134 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.22 
 
 
139 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.81 
 
 
135 aa  89.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  51.19 
 
 
133 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.14 
 
 
133 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.33 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.31 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50.6 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.12 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.31 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.38 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  49.38 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.36 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.37 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.24 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.21 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.54 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.25 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.16 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.71 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  48.75 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.86 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.78 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.71 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.83 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.78 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.78 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.18 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.0655418 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  35.78 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.78 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.78 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.78 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.78 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.53 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.78 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.29 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.7 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.11 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.53 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  50 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.92 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.09 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.43 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.13 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3511  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.47 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.66 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.53 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.25 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3186  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.74 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0578931  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  36.7 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.56 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  53.25 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.64 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.27 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.13 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.89 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.64 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.64 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.64 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.64 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.64 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.64 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.44 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.14 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.25 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.61 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.11 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4364  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.39 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.788281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4506  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.39 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.107248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.33 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.39 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.84 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.84 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.84 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.09 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.84 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.84 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.84 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.22 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.84 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>