More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3939 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
135 aa  275  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3650  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  97.78 
 
 
135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4104  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  70.45 
 
 
135 aa  191  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  70.45 
 
 
134 aa  184  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  60.61 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.09 
 
 
135 aa  159  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.33 
 
 
135 aa  155  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.58 
 
 
138 aa  153  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.27 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2933  ATP synhtase epsilon chain  44.53 
 
 
131 aa  104  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187762  normal  0.0186887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.54 
 
 
133 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.98 
 
 
139 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.86 
 
 
133 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2200  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.51 
 
 
132 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0975  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.96 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2300  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  44.19 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.349396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.88 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  49.49 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2085  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.57 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0115  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.77 
 
 
138 aa  94.7  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.4 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.96 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.96 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  47.06 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.67 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  41.12 
 
 
134 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.48 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.19 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3819  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.82 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0528  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.19 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.33 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.68 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0170  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.54 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41505  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.83 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.43 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.71 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.300977  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.62 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.02 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4735  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  48.75 
 
 
86 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461948 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2403  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.5 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0892  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.15 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1312  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.82 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0997664  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1087  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.72 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0624  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  47.06 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.88772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.92 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.19 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.26 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.25 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.41 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.48 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.61 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.38 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.38 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.38 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.36 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.41 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.33 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.78 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.25 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.96 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  30.43 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.17 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.55 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1682  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.9 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.87905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0604  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.55 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000108005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.26 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.79 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2743  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.48 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.97 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  32.48 
 
 
133 aa  62  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  34.31 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.77 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.63 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4073  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.24 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000149608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.31 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.65 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  40.91 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.78 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  40.91 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.63 
 
 
141 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.66 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 
129 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.4 
 
 
139 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.392067 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10032  ATP synthase delta chain, mitochondrial precursor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03100)  31.73 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0262441 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.65 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.74 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.48 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>