161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2345 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2345  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 343 aa  686    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.898836  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3245  hypothetical protein  39.25 
 
 		 410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4207  glycosyl transferase, group 1  40.66 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1573  glycosyl transferase, group 1  37.46 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3721  hypothetical protein  37.38 
 
 		 383 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353945  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3455  glycosyl transferase, group 1  37.38 
 
 		 383 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1435  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1023  glycosyltransferase-like protein  31.25 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2333  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3128  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1769  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0340322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2124  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  31.1 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  31.1 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  41.05 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1310  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.731702  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1327  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.294333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1346  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0723  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 363 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 		 810 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 		 389 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  28.96 
 
 		 403 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1327  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 		 336 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0360099  hitchhiker  0.00101866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1395  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 		 366 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.157053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  23.12 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1174  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 366 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  42.19 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1233  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.979929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3184  glycosyl transferase group 1  41.11 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  27.8 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  43.55 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 464 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 373 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.81 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0836  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.367499  normal  0.134682 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 415 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1085  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  29.05 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 		 1292 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  39.77 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 1220 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  24.33 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  48.98 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 428 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1279  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13501  glycosyl transferases group 1  33.88 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1801  glycosyltransferase  27.62 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1744  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  42.86 
 
 		 364 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 355 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 405 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 371 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  31.73 
 
 		 424 aa  46.2  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  47.92 
 
 		 409 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 434 aa  46.2  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  47.92 
 
 		 409 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5108  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0573721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  27.3 
 
 		 466 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  41.07 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0612  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0140  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  21.39 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  34.12 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 854 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 609 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  47.92 
 
 		 428 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>