More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4207 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007490  RSP_4207  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
375 aa  746    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3721  hypothetical protein  66.67 
 
 
383 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353945  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3455  glycosyl transferase, group 1  66.67 
 
 
383 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3245  hypothetical protein  70 
 
 
410 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1573  glycosyl transferase, group 1  43.5 
 
 
361 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2345  glycosyl transferase, group 1  40.06 
 
 
343 aa  206  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.898836  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1435  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
377 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429378  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1327  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0360099  hitchhiker  0.00101866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3128  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
437 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2333  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1769  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0340322 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1023  glycosyltransferase-like protein  28.79 
 
 
405 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  39.02 
 
 
394 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  43.62 
 
 
390 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  47.46 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1914  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  37.4 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.23 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  35.33 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  35.71 
 
 
420 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
378 aa  57.4  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  46.38 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
421 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.35 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.35 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.35 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  40.86 
 
 
390 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.35 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.35 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.35 
 
 
354 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  41.58 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
354 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
354 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
354 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  39.33 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  50 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  36.64 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  36.28 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  32.75 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2124  glycosyl transferase group 1  44.83 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  39.32 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 
457 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  39.51 
 
 
471 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 
354 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  35.71 
 
 
428 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
371 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
452 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  43.33 
 
 
354 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
448 aa  53.9  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
426 aa  53.9  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5888  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
389 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 
421 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
376 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
402 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 
448 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  31.71 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
366 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  39.56 
 
 
482 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  39.76 
 
 
1292 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3170  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
375 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
378 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0612  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0881876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
439 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 
355 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
392 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  34.81 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  41.38 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
375 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.7 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  42.7 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.7 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  46.48 
 
 
359 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.7 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.7 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.7 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.7 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>