More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3245 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3245  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  822    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3721  hypothetical protein  84.7 
 
 		 383 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353945  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3455  glycosyl transferase, group 1  84.7 
 
 		 383 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4207  glycosyl transferase, group 1  68.51 
 
 		 375 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1573  glycosyl transferase, group 1  42.45 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2345  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.898836  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1435  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2333  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1023  glycosyltransferase-like protein  30.42 
 
 		 405 aa  89.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1769  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0340322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3128  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1327  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0360099  hitchhiker  0.00101866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  26.18 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  43.62 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  29.74 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3170  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  31.45 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6051  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.03 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  30.61 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  41.43 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  28.47 
 
 		 343 aa  53.5  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  27.67 
 
 		 343 aa  53.5  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 821 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 821 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 821 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2124  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  27.67 
 
 		 343 aa  53.5  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.86 
 
 		 380 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1680  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383608  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 		 380 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 421 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 380 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.47 
 
 		 420 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 378 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.41 
 
 		 380 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.75 
 
 		 857 aa  53.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 854 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.54 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.57 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6748  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.26 
 
 		 775 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 		 856 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  28.39 
 
 		 820 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 		 856 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  38.64 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 821 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  30.61 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  28.39 
 
 		 820 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2264  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3260  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6492  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.737986  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 		 820 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 		 820 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0308  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  24.3 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.18 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  41.86 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1914  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 821 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  35.63 
 
 		 363 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.32 
 
 		 380 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 822 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 819 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2891  a-glycosyltransferase  24.63 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000073118  normal  0.0276077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  43.06 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6735  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  27.63 
 
 		 742 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2536  putative first mannosyl transferase,o- antigen biosynthesis  27.17 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  43.06 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>