25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2333 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2333  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
412 aa  847    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1023  glycosyltransferase-like protein  66.33 
 
 
405 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3245  hypothetical protein  35.38 
 
 
410 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3721  hypothetical protein  29.58 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353945  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3455  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4207  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1573  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1435  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429378  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3128  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2345  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
343 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.898836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1769  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
411 aa  59.7  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0340322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
753 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
378 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5426  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1327  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0360099  hitchhiker  0.00101866 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
381 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
820 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
353 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
816 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
384 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
421 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>