More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3721 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3455  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 383 aa  774    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3721  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  774    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353945  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3245  hypothetical protein  84.7 
 
 		 410 aa  607  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4207  glycosyl transferase, group 1  68.33 
 
 		 375 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1573  glycosyl transferase, group 1  42.45 
 
 		 361 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2345  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.898836  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1435  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 377 aa  106  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3128  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1769  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0340322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2333  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1023  glycosyltransferase-like protein  28.45 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1327  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0360099  hitchhiker  0.00101866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3682  glycosyl transferase group 1  38.13 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.45 
 
 		 775 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 452 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3260  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  37.89 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  24.28 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  41.38 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  29.85 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2811  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 854 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  30.08 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3170  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  40.98 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  23.06 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.32 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2891  a-glycosyltransferase  22.56 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000073118  normal  0.0276077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  35.85 
 
 		 431 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.19 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  35.48 
 
 		 431 aa  50.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  25.37 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2124  glycosyl transferase group 1  38.75 
 
 		 375 aa  49.7  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 		 378 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 		 366 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 398 aa  49.7  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  25.19 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6051  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.81 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.246746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  31.29 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  33.02 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  33.02 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 		 1220 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  47.54 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 924 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  38.64 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1914  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6087  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0801874  hitchhiker  0.00307291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  39.34 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  36.14 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3183  glycosyl transferase group 1  32.72 
 
 		 352 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  39.24 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0836  glycosyltransferase  28.45 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.260131  hitchhiker  0.000830652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  37.36 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  39.24 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  39.24 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  39.24 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  28.79 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  38.89 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  39.24 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  28.72 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4034  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  39.24 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4023  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 352 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 1292 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0723451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>