216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1327 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1327  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 336 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0360099  hitchhiker  0.00101866 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1435  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.429378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4207  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3721  hypothetical protein  32.48 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353945  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3455  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 		 383 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.535669  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3245  hypothetical protein  32.48 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3128  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1573  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1097  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.372916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  40.28 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  48.33 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  48.33 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  48.33 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 439 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4386  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  37.11 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2345  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 343 aa  53.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.898836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 439 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 439 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 409 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 377 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0496  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  31.31 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 739 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 		 899 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  29.89 
 
 		 480 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1701  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0309421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2124  glycosyl transferase group 1  52.27 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  38.04 
 
 		 378 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 415 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2264  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 		 385 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  43.4 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 445 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 385 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6492  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 402 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.737986  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1689  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  41.79 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  24.11 
 
 		 382 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  47.46 
 
 		 388 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.71 
 
 		 397 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1456  glycosyl transferase group 1  42.59 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2864  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  45.76 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1308  starch synthase  30.84 
 
 		 482 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.483213  normal  0.910545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  47.46 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0968  starch synthase  30.51 
 
 		 482 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  47.46 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1680  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383608  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.73 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0844  putative glycosyltransferase  38.71 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0684167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  29.21 
 
 		 371 aa  47  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1127  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.353198 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  34.34 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.34 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.34 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.28 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  38.71 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 378 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 550 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 442 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 378 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 396 aa  46.2  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2891  a-glycosyltransferase  25.95 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000073118  normal  0.0276077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 396 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  48.98 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  40.35 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2885  glycosyltransferase-like protein  32.06 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 519 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  45.76 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  43.1 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  44.68 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>