139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1290 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1290  phosphatidylserine decarboxylase-like protein  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1663  phosphatidylserine decarboxylase-related  79.11 
 
 		 225 aa  293  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0438532  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2229  phosphatidylserine decarboxylase-related  44.76 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0475225  normal  0.0214639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4863  phosphatidylserine decarboxylase  32.04 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.619442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.62 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  32.4 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  31.9 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  30.32 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  27.16 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  30.41 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  28.81 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  28.36 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  29.84 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  29.23 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1992  phosphatidylserine decarboxylase  28.37 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  31.03 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0665  phosphatidylserine decarboxylase related protein  26.92 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3828  phosphatidylserine decarboxylase related protein  29.38 
 
 		 417 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3717  phosphatidylserine decarboxylase  28.83 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00382056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  29.75 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  25.53 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  29.19 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4218  phosphatidylserine decarboxylase related protein  29.27 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  27.96 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  29.75 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0965  phosphatidylserine decarboxylase  27.66 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.196296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  26.9 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  30.52 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  30.28 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1330  phosphatidylserine decarboxylase related protein  28.9 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  30.28 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  31.91 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  30.46 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  30.28 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  30.28 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2597  phosphatidylserine decarboxylase  26.62 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  31.91 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  30.28 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07916  putative phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  27.66 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  27.53 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0357  phosphatidylserine decarboxylase  26.38 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  30.28 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  30.28 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  30.28 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2518  phosphatidylserine decarboxylase  31.55 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.619064  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  26.85 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  30.46 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  30.46 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  30.5 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  30.5 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  30.5 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0116  phosphatidylserine decarboxylase related protein  26.54 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000497171  hitchhiker  0.00000000948929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  29.79 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  30.5 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  30.5 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  26.88 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0875  phosphatidylserine decarboxylase  26.52 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  30.77 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  25.84 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  26.83 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0348  phosphatidylserine decarboxylase  22.68 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0565253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  26 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  28.57 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4178  phosphatidylserine decarboxylase related protein  29.69 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  24.37 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  28.21 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  25.25 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  28.21 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2004  phosphatidylserine decarboxylase-like protein  31.29 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  26.67 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  27.84 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3390  Phosphatidylserine decarboxylase  32.09 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948403  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  25.93 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3556  phosphatidylserine decarboxylase  28.4 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  28.24 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  26.97 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  28.73 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  25.93 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  28.28 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  30.81 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  26 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  29.23 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0288  phosphatidylserine decarboxylase-related  31.9 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6049  Phosphatidylserine decarboxylase  30.56 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  31.17 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  26.98 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  30.25 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  26.92 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  26.92 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  27.51 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  26.73 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6313  Phosphatidylserine decarboxylase  24.5 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  25.26 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  28.57 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1894  phosphatidylserine decarboxylase  29.07 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.542259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2825  phosphatidylserine decarboxylase related protein  29.44 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  25.93 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>