145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0288 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0288  phosphatidylserine decarboxylase-related  100 
 
 		 212 aa  397  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4863  phosphatidylserine decarboxylase  40.1 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.619442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6313  Phosphatidylserine decarboxylase  36.41 
 
 		 404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3828  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.98 
 
 		 417 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4218  phosphatidylserine decarboxylase related protein  43.29 
 
 		 418 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  40.66 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  40.29 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  39.61 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  40.72 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  41.45 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  29.27 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0875  phosphatidylserine decarboxylase  33.71 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  39.66 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  39.11 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  39.11 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  39.11 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  37.5 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  39.11 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2825  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.51 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  38.55 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  34.74 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  39.11 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  39.11 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  35.21 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1894  phosphatidylserine decarboxylase  39.6 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.542259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  34.74 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  34.57 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  40.68 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  40.68 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6049  Phosphatidylserine decarboxylase  37.5 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2004  phosphatidylserine decarboxylase-like protein  40.88 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.542962 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  40.68 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  40.68 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  40.68 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  40.68 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  40.68 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  40.68 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  38.33 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2518  phosphatidylserine decarboxylase  39.44 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.619064  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  40.31 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  35.4 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.8 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.12 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2075  phosphatidylserine decarboxylase  37.86 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  36.61 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  38.04 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  34.43 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  35.39 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  38.33 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34500  phosphatidylserine decarboxylase precursor-related protein  40.38 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  35.39 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  33.97 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  38.38 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  37.21 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.42 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  39.3 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  35.54 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.95 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  39.11 
 
 		 232 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  39.11 
 
 		 232 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  31.93 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  33.49 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1493  phosphatidylserine decarboxylase  36.79 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349217  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  32.82 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  33.78 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  36.06 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  38.65 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0153  phosphatidylserine decarboxylase  44.97 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  32.96 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  33.98 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  39.05 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  34.05 
 
 		 230 aa  91.7  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4178  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.78 
 
 		 229 aa  91.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.09 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  36.42 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.54 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  37.14 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  37.28 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  34.57 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  37.84 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  37.28 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.5 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  33.5 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  34.47 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  34.3 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  33.51 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  32.23 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0116  phosphatidylserine decarboxylase related protein  35.22 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000497171  hitchhiker  0.00000000948929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0594  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2217  phosphatidylserine decarboxylase  35.71 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0607  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0585  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0348  phosphatidylserine decarboxylase  26.6 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0565253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  35.84 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  36.53 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  36.99 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  41.14 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1028  phosphatidylserine decarboxylase related protein  34.65 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250068  normal  0.0464549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.43 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>