152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1529 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.26 
 
 		 190 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.81 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.85 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.7 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.91 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.13 
 
 		 199 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.41 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.06 
 
 		 189 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.5 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.44 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.8 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.78 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.21 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.35 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  40.3 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.09 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  39.09 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.86 
 
 		 208 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  39.8 
 
 		 193 aa  126  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  39.9 
 
 		 201 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.42 
 
 		 206 aa  125  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  42 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.76 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  40.4 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  42.16 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.59 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.59 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  38.42 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  38.83 
 
 		 196 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.89 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.87 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.83 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  39.59 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.19 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.41 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.64 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  37.38 
 
 		 217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  35.07 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  42.05 
 
 		 184 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  40.89 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  40.89 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.13 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.63 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  35.55 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.38 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.15 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  42.05 
 
 		 184 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  39.49 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.1 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.4 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  40.39 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  37.11 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.69 
 
 		 216 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.81 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  36.36 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.83 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  39.55 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.06 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  41.87 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.89 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  34.03 
 
 		 180 aa  112  5e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  37.95 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  42 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.41 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  38.28 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  38.57 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  35.35 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  39.38 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  38.86 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.73 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.82 
 
 		 224 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.62 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  37.31 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  38.1 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  37.62 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  38.1 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  37.62 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  37.62 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  38.1 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  38.1 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.93 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  33.33 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  38.28 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.23 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.58 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.81 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  34.03 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.58 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  36.51 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0291  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.71 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.51 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.75 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.85 
 
 		 212 aa  101  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  37.14 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  33.33 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.96 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  37 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.7 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  36 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>