156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2580 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  97.07 
 
 		 205 aa  401  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  52.94 
 
 		 217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 		 205 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 		 205 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 		 205 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  48.31 
 
 		 204 aa  201  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  47.6 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  47.6 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  47.12 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  46.86 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.29 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.12 
 
 		 197 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.46 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.65 
 
 		 186 aa  157  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.44 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.16 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.18 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.71 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.16 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.35 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  41.18 
 
 		 183 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  40.69 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.14 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.75 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.08 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.95 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.92 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.39 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.45 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40.91 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  35.18 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.39 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  36.95 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.47 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  34.17 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  34.17 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.81 
 
 		 196 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.95 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  35.47 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.18 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  33.66 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  38.78 
 
 		 170 aa  122  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.82 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.16 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  36.45 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.5 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  40.3 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.75 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.17 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.07 
 
 		 216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.68 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0162  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.27 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.145239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  37 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  37.13 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.04 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  36.59 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  35.29 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.34 
 
 		 206 aa  114  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  40.41 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  36.32 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1931  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.68 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  37.5 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2368  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.18 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2414  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.18 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.73 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.82 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.82 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.51 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  34.48 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.5 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  33 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  37.19 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.45 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.95 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.17 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  33.84 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.67 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.67 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  33.17 
 
 		 184 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  29.9 
 
 		 222 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  30.35 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  35.47 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  35.27 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  29.9 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  29.38 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.41 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.34 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.19 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.75 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.16 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.85 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.64 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.61 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.05 
 
 		 215 aa  98.2  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>