154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1309 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.7 
 
 		 190 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  50 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.84 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.1 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  49.44 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.86 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  47.98 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  41.62 
 
 		 208 aa  140  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.2 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  54 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  47.56 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  54 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  47.13 
 
 		 201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  44.51 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  53.42 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.61 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.99 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.69 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.58 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  52.74 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  52.05 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  46.75 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.2 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  48.28 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.68 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.52 
 
 		 201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  46.02 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.2 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  43.79 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.11 
 
 		 216 aa  127  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.2 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  42.86 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  43.87 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.94 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  47.44 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  41.48 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  47.44 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.45 
 
 		 201 aa  124  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.93 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.68 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.93 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  44.63 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  45.51 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  45.51 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  43.83 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.05 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  45 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.35 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.89 
 
 		 216 aa  120  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.04 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  39.08 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.1 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  45.06 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1601  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.57 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0269163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.89 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03131  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.78 
 
 		 189 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.9 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.77 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40.21 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.7 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.38 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  40.96 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  41.4 
 
 		 217 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40.43 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.98 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0291  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.21 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.67 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  41.42 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.32 
 
 		 214 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.64 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.68 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.56 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.95 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  40.72 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.69 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  40.13 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  37.41 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  35.75 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  40.76 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.64 
 
 		 230 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.18 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  35.2 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.79 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.55 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  43.54 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02661  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.1 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.98 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.24 
 
 		 201 aa  96.3  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.77 
 
 		 212 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  38.98 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  40.38 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.91 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.27 
 
 		 262 aa  94.7  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  37.84 
 
 		 189 aa  94.7  7e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  40.49 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.41 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.1 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.71 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.31 
 
 		 224 aa  92  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>