153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5540 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
189 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
189 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  81.38 
 
 
203 aa  320  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  76.47 
 
 
189 aa  294  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  67.58 
 
 
208 aa  248  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  66.48 
 
 
208 aa  246  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  66.3 
 
 
192 aa  246  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  67.22 
 
 
189 aa  234  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  60.22 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  59.89 
 
 
193 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  57.39 
 
 
182 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  61.02 
 
 
185 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  57.71 
 
 
181 aa  202  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  55.8 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  56.74 
 
 
201 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  54.19 
 
 
208 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  53.98 
 
 
205 aa  190  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  53.55 
 
 
224 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  53.41 
 
 
205 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  55.87 
 
 
206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  53.37 
 
 
202 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  55.62 
 
 
184 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  52.49 
 
 
184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  55.06 
 
 
184 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.59 
 
 
192 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.55 
 
 
204 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  46.84 
 
 
207 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  47.37 
 
 
258 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  46.32 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  46.32 
 
 
207 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  46.32 
 
 
207 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.32 
 
 
209 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.98 
 
 
192 aa  134  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.04 
 
 
190 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.68 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.71 
 
 
216 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.61 
 
 
216 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  44.72 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.93 
 
 
190 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.59 
 
 
216 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.5 
 
 
199 aa  121  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  40.2 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  42 
 
 
212 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  36 
 
 
187 aa  118  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  39.2 
 
 
205 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  39.2 
 
 
205 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  39.2 
 
 
205 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.54 
 
 
199 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.41 
 
 
194 aa  117  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  39.2 
 
 
205 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  38.69 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  40 
 
 
196 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  43.93 
 
 
197 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.3 
 
 
207 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  38.69 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.02 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 
204 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.09 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  33.16 
 
 
189 aa  111  5e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.18 
 
 
208 aa  111  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.46 
 
 
196 aa  110  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.63 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.58 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  40.72 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.31 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.89 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  33.33 
 
 
180 aa  107  8.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  41.3 
 
 
203 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.01 
 
 
168 aa  106  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.11 
 
 
213 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.17 
 
 
201 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.88 
 
 
211 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.04 
 
 
206 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.83 
 
 
262 aa  104  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.34 
 
 
234 aa  104  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.22 
 
 
201 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  35.84 
 
 
170 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.9 
 
 
220 aa  101  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  36.26 
 
 
189 aa  100  9e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.55 
 
 
197 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  37.04 
 
 
225 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.29 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  35.82 
 
 
217 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.62 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.22 
 
 
217 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.79 
 
 
222 aa  98.2  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1601  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  34.9 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0269163  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.78 
 
 
224 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.91 
 
 
232 aa  96.7  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.11 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.18 
 
 
226 aa  96.3  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.95 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.66 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.7 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.82 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.32 
 
 
230 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03131  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  34.38 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>