155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0935 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
208 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  98.08 
 
 
208 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  90.66 
 
 
192 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  69.95 
 
 
189 aa  256  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  67.58 
 
 
189 aa  248  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  67.58 
 
 
189 aa  248  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  66.85 
 
 
203 aa  248  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  67.04 
 
 
189 aa  232  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  61.36 
 
 
182 aa  214  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  56.15 
 
 
196 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  57.87 
 
 
193 aa  209  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  58.56 
 
 
185 aa  209  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  57.46 
 
 
206 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  58.19 
 
 
181 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  57.54 
 
 
201 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  55.56 
 
 
208 aa  201  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  56.52 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  54.55 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  53.8 
 
 
205 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  59.32 
 
 
184 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  55.31 
 
 
202 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  58.76 
 
 
184 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  55.49 
 
 
184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  52.22 
 
 
206 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.66 
 
 
192 aa  161  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.65 
 
 
190 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  49.21 
 
 
207 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.51 
 
 
192 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  48.68 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  48.68 
 
 
207 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  48.68 
 
 
207 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.57 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  47.62 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  54 
 
 
190 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.08 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.35 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.16 
 
 
209 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.86 
 
 
201 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.54 
 
 
199 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 
213 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  45.3 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  43.43 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.5 
 
 
199 aa  119  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.15 
 
 
216 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.55 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.7 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.64 
 
 
262 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.09 
 
 
222 aa  115  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.15 
 
 
194 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.85 
 
 
206 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.68 
 
 
196 aa  115  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  44 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.57 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40.43 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  40.74 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.03 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0291  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.56 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.17 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.2 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.55 
 
 
214 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  40.76 
 
 
203 aa  111  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  35.75 
 
 
180 aa  111  7.000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.6 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.75 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.46 
 
 
201 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.93 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  38.19 
 
 
205 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  34.17 
 
 
205 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  43.78 
 
 
201 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  36.98 
 
 
198 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  37.69 
 
 
205 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  36 
 
 
211 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.02 
 
 
216 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  38.19 
 
 
204 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  37.69 
 
 
205 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  35.71 
 
 
189 aa  105  5e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  44.97 
 
 
213 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  38.46 
 
 
217 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  33.67 
 
 
205 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.35 
 
 
168 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  39.41 
 
 
189 aa  104  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  37.19 
 
 
205 aa  104  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  37.19 
 
 
205 aa  104  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  37.19 
 
 
205 aa  104  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  37.19 
 
 
205 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  43.23 
 
 
203 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  37.19 
 
 
205 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 
234 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  36.26 
 
 
170 aa  102  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 
201 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  37.19 
 
 
205 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.39 
 
 
224 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  38.19 
 
 
204 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.23 
 
 
215 aa  101  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.47 
 
 
186 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.08 
 
 
187 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  38.1 
 
 
183 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.65 
 
 
232 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.08 
 
 
198 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>