155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1830 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  89.71 
 
 		 208 aa  378  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  72.86 
 
 		 201 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  72.41 
 
 		 206 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  73.94 
 
 		 196 aa  296  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  69.95 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  69.79 
 
 		 202 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  59.89 
 
 		 193 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.68 
 
 		 189 aa  208  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.01 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.35 
 
 		 192 aa  201  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.75 
 
 		 189 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.49 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.87 
 
 		 189 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.87 
 
 		 189 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  55.49 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  53.89 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.78 
 
 		 208 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  54.5 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.22 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  52.22 
 
 		 185 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.87 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  51.67 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  52.22 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  50.26 
 
 		 184 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  45.96 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.77 
 
 		 192 aa  154  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  46.11 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  46.11 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.98 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.86 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  45.08 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.64 
 
 		 192 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  45.83 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.93 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.05 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.21 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  40.53 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  46.89 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  40.1 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  46.89 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  46.33 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.93 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  46.33 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  39.5 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.38 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.61 
 
 		 186 aa  121  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.75 
 
 		 195 aa  121  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.79 
 
 		 199 aa  121  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.27 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.07 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.45 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.05 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  43.6 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.82 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  37 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.63 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.05 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.41 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.96 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.16 
 
 		 219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.5 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.82 
 
 		 216 aa  117  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  41.21 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.68 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02661  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.67 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  45 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  39.01 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.38 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  40.46 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  38.59 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  36.27 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.11 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  47.56 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.62 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40.8 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.6 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  38.69 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.02 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  35.96 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.19 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.09 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.06 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.31 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.15 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.02 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  34.98 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.67 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.22 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  37.19 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  37.19 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  36.41 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  37.69 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  38.51 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.99 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>