155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1889 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
208 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  59.16 
 
 
199 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  56.41 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.38 
 
 
201 aa  215  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  54.89 
 
 
203 aa  205  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.11 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.92 
 
 
190 aa  171  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.66 
 
 
192 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.85 
 
 
216 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.89 
 
 
187 aa  153  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.74 
 
 
192 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  42.65 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.2 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  42.16 
 
 
205 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  43.35 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.59 
 
 
204 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  41.62 
 
 
213 aa  142  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  43.68 
 
 
258 aa  141  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 
206 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  42.63 
 
 
207 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  40.82 
 
 
183 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  40.7 
 
 
196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  43.72 
 
 
204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.95 
 
 
211 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  41.33 
 
 
183 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  41.84 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  41.84 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  41.33 
 
 
207 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  42.71 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  42.71 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  42.71 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  42.71 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  42.71 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  42.71 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  42.71 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.11 
 
 
205 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.67 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  40.64 
 
 
224 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.03 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  42.25 
 
 
202 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.84 
 
 
206 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  40.86 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  40.22 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.2 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  41.71 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  41.21 
 
 
205 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  40 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.46 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.62 
 
 
201 aa  128  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  39.67 
 
 
184 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.49 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  40.33 
 
 
180 aa  125  5e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.21 
 
 
201 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  36.28 
 
 
228 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  39.78 
 
 
189 aa  124  1e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.42 
 
 
207 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.56 
 
 
206 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.69 
 
 
201 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.7 
 
 
216 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  37.84 
 
 
184 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  43.02 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.78 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.46 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  38.22 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.25 
 
 
226 aa  118  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.09 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.83 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.46 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.14 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.68 
 
 
214 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 
208 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.82 
 
 
240 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.31 
 
 
209 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.01 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  37.3 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  40 
 
 
170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  36.41 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.71 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  36.13 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.23 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  37.11 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.17 
 
 
212 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.11 
 
 
224 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.76 
 
 
197 aa  112  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.83 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.77 
 
 
207 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.38 
 
 
186 aa  112  5e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  38.5 
 
 
206 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.27 
 
 
219 aa  111  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  38.38 
 
 
205 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.18 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.18 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.33 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  36.65 
 
 
205 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2368  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.5 
 
 
202 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2414  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.5 
 
 
202 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.79 
 
 
215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>