152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2004 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
201 aa  414  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.45 
 
 
201 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.5 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  40.1 
 
 
225 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.28 
 
 
221 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.49 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.36 
 
 
192 aa  150  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.53 
 
 
187 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0291  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.44 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.41 
 
 
190 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.87 
 
 
222 aa  140  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.13 
 
 
192 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.58 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02661  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.25 
 
 
165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  42.71 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03131  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.16 
 
 
189 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1601  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.61 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0269163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.52 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.62 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  38.31 
 
 
196 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.5 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.06 
 
 
206 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  41.03 
 
 
224 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.55 
 
 
196 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.22 
 
 
201 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.59 
 
 
199 aa  122  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  40.21 
 
 
201 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  40 
 
 
206 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  37.44 
 
 
208 aa  121  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  38.46 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  40.8 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.23 
 
 
211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  37.63 
 
 
189 aa  118  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  38.78 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.68 
 
 
198 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.75 
 
 
196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  40.22 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.88 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.83 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.76 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  39.8 
 
 
183 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.14 
 
 
204 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  36.36 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  35.94 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  38.92 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.64 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  38.92 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  38.92 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  38.92 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  38.98 
 
 
213 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  38.92 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  37.31 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  38.81 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  38.92 
 
 
205 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  38.92 
 
 
205 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  38.27 
 
 
183 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  38.92 
 
 
205 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.08 
 
 
189 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.03 
 
 
224 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.46 
 
 
208 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  34.72 
 
 
189 aa  108  6e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.64 
 
 
216 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.46 
 
 
208 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.62 
 
 
216 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.67 
 
 
206 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.56 
 
 
186 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.14 
 
 
135 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0675671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  38.31 
 
 
204 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.06 
 
 
186 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  33.33 
 
 
184 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.17 
 
 
189 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.17 
 
 
189 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  36.65 
 
 
205 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02551  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.43 
 
 
135 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.31 
 
 
186 aa  105  5e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.11 
 
 
209 aa  104  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  34.97 
 
 
168 aa  104  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.74 
 
 
216 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.68 
 
 
220 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.38 
 
 
205 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.31 
 
 
192 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0162  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.35 
 
 
212 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.145239  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.14 
 
 
187 aa  102  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.16 
 
 
203 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  33.16 
 
 
184 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  36.82 
 
 
198 aa  101  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.2 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  40.13 
 
 
228 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  34.65 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  35.23 
 
 
207 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  35.23 
 
 
207 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.67 
 
 
240 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  36.7 
 
 
258 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.68 
 
 
194 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.51 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  36.18 
 
 
181 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.9 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  34.72 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>