156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2901 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 
205 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  97.07 
 
 
205 aa  401  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  52.94 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 
205 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 
205 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 
205 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 
205 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  48.31 
 
 
204 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  48.08 
 
 
205 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  47.6 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  47.6 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  47.12 
 
 
205 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  46.86 
 
 
204 aa  194  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.8 
 
 
198 aa  191  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.09 
 
 
197 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.95 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.14 
 
 
186 aa  157  9e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  41.18 
 
 
198 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.95 
 
 
201 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.18 
 
 
186 aa  148  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.65 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.69 
 
 
186 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.22 
 
 
196 aa  144  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.06 
 
 
199 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.62 
 
 
187 aa  142  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  40.69 
 
 
183 aa  140  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  41.18 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.25 
 
 
194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.16 
 
 
190 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.45 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  36.45 
 
 
207 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.62 
 
 
211 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  34.67 
 
 
207 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.42 
 
 
192 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40.91 
 
 
203 aa  134  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  34.17 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  34.17 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.81 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.96 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.98 
 
 
210 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.95 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  36.71 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.82 
 
 
216 aa  121  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.2 
 
 
209 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  32.67 
 
 
213 aa  121  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0162  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.07 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.145239  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.5 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  40.8 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  38.78 
 
 
170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.24 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.56 
 
 
207 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.75 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  35.96 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.95 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.55 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.67 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.68 
 
 
210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  36.32 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  36.59 
 
 
196 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.34 
 
 
206 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1931  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.32 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  35.82 
 
 
189 aa  112  5e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  34.8 
 
 
224 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  40.1 
 
 
189 aa  111  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2368  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.83 
 
 
202 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2414  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.83 
 
 
202 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.54 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  38.19 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.27 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.28 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  34.34 
 
 
193 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
180 aa  107  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.83 
 
 
206 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.92 
 
 
201 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.67 
 
 
208 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.17 
 
 
208 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  34.98 
 
 
208 aa  106  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  33 
 
 
192 aa  104  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.95 
 
 
204 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.73 
 
 
240 aa  104  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  35.27 
 
 
202 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  30.35 
 
 
222 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  35.47 
 
 
206 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  29.9 
 
 
222 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  32.35 
 
 
184 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  29.9 
 
 
225 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.85 
 
 
194 aa  101  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  30.81 
 
 
228 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.16 
 
 
189 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.64 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.69 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.2 
 
 
190 aa  99  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.41 
 
 
189 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.18 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.95 
 
 
224 aa  97.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03131  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  30.73 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  33 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  32.32 
 
 
184 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>