156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3948 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  74.19 
 
 
208 aa  293  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  75.13 
 
 
206 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  73.94 
 
 
201 aa  283  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  72.58 
 
 
202 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  73.94 
 
 
206 aa  279  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  72.58 
 
 
224 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  61.8 
 
 
193 aa  228  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.22 
 
 
189 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.22 
 
 
189 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  57.78 
 
 
189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.76 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.68 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.15 
 
 
208 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  59.67 
 
 
182 aa  211  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.91 
 
 
192 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  56.11 
 
 
181 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.24 
 
 
189 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  56.98 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  54.7 
 
 
205 aa  194  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.61 
 
 
204 aa  191  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  55 
 
 
205 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  53.8 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  54.35 
 
 
184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  53.3 
 
 
184 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.08 
 
 
192 aa  178  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  48.22 
 
 
207 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  48.22 
 
 
207 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  47.15 
 
 
207 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.03 
 
 
190 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  47.67 
 
 
258 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  47.21 
 
 
207 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.95 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.84 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.32 
 
 
209 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.56 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  44 
 
 
199 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.97 
 
 
215 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.36 
 
 
216 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  42.33 
 
 
213 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.85 
 
 
195 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.7 
 
 
208 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.89 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  44.97 
 
 
197 aa  131  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.49 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.03 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  41.71 
 
 
205 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.31 
 
 
201 aa  127  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  44.21 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.05 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  41.09 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.63 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.76 
 
 
205 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  43.41 
 
 
168 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.22 
 
 
186 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  41.71 
 
 
205 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40.76 
 
 
203 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.45 
 
 
201 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  43.52 
 
 
203 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  42.42 
 
 
204 aa  122  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  41.21 
 
 
205 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  39.7 
 
 
205 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  43.5 
 
 
204 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  43.5 
 
 
204 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  37.11 
 
 
198 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.83 
 
 
216 aa  121  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.91 
 
 
216 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  40 
 
 
217 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  40.7 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  40.7 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  40.7 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  40.7 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.4 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  40.2 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  41.53 
 
 
201 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40.62 
 
 
222 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.24 
 
 
197 aa  118  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.89 
 
 
226 aa  118  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.12 
 
 
186 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.5 
 
 
224 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.08 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.41 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.44 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  38.25 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.36 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.32 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.61 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.75 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  36.59 
 
 
205 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.62 
 
 
216 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  38.69 
 
 
204 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.21 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.17 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  39.11 
 
 
189 aa  114  8.999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  38.38 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.33 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  36.59 
 
 
205 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  44.25 
 
 
203 aa  112  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  39.08 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.17 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.319248 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>