155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1042 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  97.83 
 
 		 184 aa  357  6e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  81.52 
 
 		 184 aa  300  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  56.52 
 
 		 185 aa  205  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  59.24 
 
 		 224 aa  200  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  59.44 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  59.89 
 
 		 182 aa  197  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  57.06 
 
 		 205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  56.28 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  57.75 
 
 		 193 aa  195  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.45 
 
 		 189 aa  193  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.45 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  57.69 
 
 		 201 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  56.11 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.76 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.19 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  53.8 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  57.87 
 
 		 203 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.82 
 
 		 189 aa  181  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  54.4 
 
 		 208 aa  180  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  54.44 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.62 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.62 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  51.67 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.47 
 
 		 192 aa  159  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  48.91 
 
 		 258 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.36 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.07 
 
 		 204 aa  140  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  47.28 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  48.91 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  48.91 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.42 
 
 		 190 aa  137  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  48.37 
 
 		 207 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  45.11 
 
 		 213 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.82 
 
 		 216 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.02 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.32 
 
 		 209 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.96 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.98 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  46.19 
 
 		 228 aa  131  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.39 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.22 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.01 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.3 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.57 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.03 
 
 		 212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.54 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.08 
 
 		 205 aa  127  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.7 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  44.86 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.54 
 
 		 220 aa  124  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  46.78 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  46.63 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.43 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  45.28 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  40 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.05 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.58 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  39.51 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  38.54 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  39.51 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  39.51 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  38.54 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.92 
 
 		 215 aa  117  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.57 
 
 		 199 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  39.51 
 
 		 205 aa  117  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  39.51 
 
 		 205 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  38.54 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.75 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.01 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.83 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.44 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  39.71 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.74 
 
 		 207 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  43.16 
 
 		 204 aa  114  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.1 
 
 		 201 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.58 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.7 
 
 		 214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.64 
 
 		 219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.15 
 
 		 221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.85 
 
 		 210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  42.62 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.04 
 
 		 230 aa  111  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.57 
 
 		 209 aa  111  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.01 
 
 		 232 aa  111  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.24 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.11 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  42.7 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  42.7 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  42.7 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.1 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.49 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.03 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  37.63 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.71 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.25 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  33.52 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.5 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.86 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>