155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2114 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  95.68 
 
 		 186 aa  358  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  61.54 
 
 		 183 aa  243  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  60.99 
 
 		 183 aa  242  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.56 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  55 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.33 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.7 
 
 		 194 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  43.14 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  43.84 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  43.84 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  44.28 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  43.84 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  43.84 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  43.35 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  43.35 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  43.35 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  43.35 
 
 		 204 aa  157  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  42.36 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  42.86 
 
 		 204 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  42.16 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.05 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.72 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  41.18 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.3 
 
 		 190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  46.2 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.71 
 
 		 201 aa  140  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.45 
 
 		 206 aa  140  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.44 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.85 
 
 		 192 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  44.79 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  37.99 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  40 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.03 
 
 		 206 aa  128  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  38.97 
 
 		 207 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.9 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  44.22 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.78 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  39.49 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  45.03 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  43.1 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  43.22 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  41.12 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  40.61 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  38.97 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  38.97 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  37.91 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.69 
 
 		 199 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.8 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.06 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.19 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  39.49 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  35.35 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.56 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  37.95 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.97 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.18 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.48 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  45.03 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.89 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.94 
 
 		 220 aa  111  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.42 
 
 		 224 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.2 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.01 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.56 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.58 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.1 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.44 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  38.42 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3144  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.45 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00878539  normal  0.470137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  38.62 
 
 		 205 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.09 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  37.43 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.02 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.58 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.47 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.64 
 
 		 182 aa  101  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  36.7 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.06 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.47 
 
 		 208 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.67 
 
 		 215 aa  100  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.18 
 
 		 212 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.22 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0291  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.62 
 
 		 226 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.6 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.29 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.29 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.41 
 
 		 222 aa  98.6  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.7 
 
 		 230 aa  99  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2368  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.62 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2414  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.62 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40 
 
 		 168 aa  98.2  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  38.89 
 
 		 225 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  37.1 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1931  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.09 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.11 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.62 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.87 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.11 
 
 		 210 aa  95.9  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>