140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3144 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3144  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
193 aa  387  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00878539  normal  0.470137 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0162  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.19 
 
 
212 aa  134  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.145239  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.32 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  40.45 
 
 
198 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.36 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.47 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.94 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.21 
 
 
207 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.59 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.21 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  38.98 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  40.45 
 
 
183 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.47 
 
 
209 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.45 
 
 
186 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.94 
 
 
206 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  34.25 
 
 
189 aa  104  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.36 
 
 
198 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  37.06 
 
 
170 aa  102  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.36 
 
 
203 aa  101  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.82 
 
 
221 aa  100  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  33.7 
 
 
180 aa  100  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  33 
 
 
208 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.74 
 
 
201 aa  99  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.97 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.56 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  36.62 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  35.96 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1601  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.16 
 
 
189 aa  95.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0269163  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03131  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.16 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  32.67 
 
 
205 aa  92  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.53 
 
 
196 aa  91.3  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  32.67 
 
 
205 aa  90.9  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.02 
 
 
209 aa  88.2  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02661  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  33.33 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.26 
 
 
197 aa  87  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  31.77 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  32.66 
 
 
217 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.3 
 
 
201 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  30.9 
 
 
222 aa  85.5  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.67 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.84 
 
 
209 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.98 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0291  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 
226 aa  84.7  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.01 
 
 
168 aa  84.7  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.7 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  28.57 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.49 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  30.95 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.9 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  29.76 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.69 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.7 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  31.12 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  31.12 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  34.05 
 
 
204 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.09 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.26 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  31.31 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.44 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  30.46 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.68 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.57 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  34.02 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  31.31 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  31.31 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  31.31 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  31.31 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  31.31 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.15 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.16 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.26 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.05 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.76 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.14 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.84 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.71 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.54 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.27 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.29 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.34 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.22 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  30.77 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.15 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  35.76 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.04 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.78 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02551  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  33.08 
 
 
135 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.37 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.81 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  34.3 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  31.86 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.31 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0675671  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.1 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1931  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.43 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.4 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  34.72 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.43 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  34.72 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1791  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.58 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>