143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1287 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.36 
 
 		 211 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  56.08 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.02 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  57.59 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.5 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.85 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  52.06 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.08 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  53.97 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  53.97 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.14 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  53.97 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.89 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.47 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.45 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.87 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  53.57 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.46 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  48.02 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.45 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.15 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  56.98 
 
 		 174 aa  138  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  50.28 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.04 
 
 		 214 aa  134  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.51 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.79 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.91 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.4 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  42.33 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  42.86 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  42.33 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  42.33 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  42.33 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  42.33 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.32 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  41.45 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  41.45 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  41.45 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  41.33 
 
 		 204 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  45.68 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.2 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  41.99 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  39.27 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  44.51 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.74 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  47.37 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  39.38 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.59 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.73 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  42.37 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.67 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  43.21 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  43.21 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.7 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.46 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.63 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.29 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.09 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  43.21 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.77 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  44.51 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  43.65 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.98 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  45.25 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.88 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  43.33 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.31 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  43.5 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  44.44 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  43.82 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  35.64 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  35.64 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.51 
 
 		 187 aa  99  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.81 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  36.51 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.5 
 
 		 201 aa  98.6  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.61 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.5 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  43.1 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.76 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.02 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  43.65 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.36 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.18 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.62 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.94 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.11 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  40.35 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.2 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.46 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.66 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.94 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.27 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.24 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  36.42 
 
 		 170 aa  91.7  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  39.53 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  38.71 
 
 		 183 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  38.25 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.57 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>