155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7036 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
209 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.85 
 
 
201 aa  203  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  48.73 
 
 
198 aa  194  9e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  45.37 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  41.46 
 
 
205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  41.95 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  44.04 
 
 
204 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.82 
 
 
198 aa  153  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  43.59 
 
 
205 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  43.59 
 
 
205 aa  147  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  43.59 
 
 
205 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  43.59 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  43.59 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  44.04 
 
 
204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  43.59 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  43.08 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  43.08 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  43.08 
 
 
205 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.9 
 
 
210 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.88 
 
 
210 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.94 
 
 
186 aa  141  7e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.15 
 
 
207 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.37 
 
 
194 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.93 
 
 
206 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.64 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  43.43 
 
 
183 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  42.35 
 
 
183 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 
190 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  40 
 
 
199 aa  121  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.8 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  39 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.73 
 
 
196 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  40.51 
 
 
224 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.3 
 
 
211 aa  118  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  38.38 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  38.38 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.2 
 
 
210 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2368  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.1 
 
 
202 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.19 
 
 
210 aa  116  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2414  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.1 
 
 
202 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.17 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.76 
 
 
203 aa  115  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.31 
 
 
208 aa  115  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.61 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.31 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.8 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.36 
 
 
215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  37.62 
 
 
207 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.07 
 
 
201 aa  111  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0162  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.65 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.145239  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.2 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1931  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.17 
 
 
205 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  36.82 
 
 
258 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.64 
 
 
190 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3144  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.47 
 
 
193 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00878539  normal  0.470137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.3 
 
 
206 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  38.42 
 
 
201 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.33 
 
 
211 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.56 
 
 
262 aa  102  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  42.5 
 
 
184 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 
196 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  37.11 
 
 
206 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.23 
 
 
205 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  42.5 
 
 
184 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0087  3-methyladenine DNA glycosylase  33.9 
 
 
189 aa  101  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0848019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  38.14 
 
 
202 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  38.95 
 
 
184 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.96 
 
 
216 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.06 
 
 
240 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.52 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  35.48 
 
 
213 aa  99  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.57 
 
 
212 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  34 
 
 
216 aa  98.2  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.29 
 
 
221 aa  97.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.36 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  38.3 
 
 
170 aa  97.4  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.29 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.87 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  35.71 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.17 
 
 
187 aa  95.1  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.26 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  36 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.91 
 
 
224 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.75 
 
 
201 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.9 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.9 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.14 
 
 
168 aa  93.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.86 
 
 
192 aa  92  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.34 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.1 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.52 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  35.94 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.82 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.79 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  37.14 
 
 
189 aa  89.4  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.87 
 
 
212 aa  89  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  34.81 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  35.6 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.44 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>