155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3154 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 215 aa  417  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  58.96 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.46 
 
 		 209 aa  207  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.39 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.45 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.63 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  53.92 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.22 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.36 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.59 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.87 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  54 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  50.51 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.06 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  60 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.68 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.55 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.27 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  47.12 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.06 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.06 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  47.09 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  47.09 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.27 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  46.56 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  45.45 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.52 
 
 		 240 aa  151  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  47.98 
 
 		 196 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.67 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.45 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.24 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  44.33 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  46.88 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.34 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.96 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  43.81 
 
 		 202 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.22 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  44.85 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.36 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.31 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  42.93 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  38.81 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.9 
 
 		 190 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  42 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.14 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  45.55 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.01 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  41.71 
 
 		 193 aa  121  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  46.07 
 
 		 184 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.57 
 
 		 187 aa  121  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  45.21 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.99 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.3 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.4 
 
 		 203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  42.71 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  37.71 
 
 		 183 aa  118  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.59 
 
 		 194 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.45 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.15 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.05 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  37.71 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.36 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.98 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.78 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.96 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.71 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.27 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.95 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  40.21 
 
 		 201 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.46 
 
 		 196 aa  112  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.89 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.53 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  41.18 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  40.53 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  34.22 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  40.85 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  40.64 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  39.36 
 
 		 205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.38 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.23 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.62 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.62 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  35.35 
 
 		 189 aa  105  7e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  39 
 
 		 207 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  31.69 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  46.07 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.02 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  41.75 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.7 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.66 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.29 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  30.05 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.91 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  34.01 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  30.05 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.71 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.52 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.78 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>