152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3167 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 212 aa  401  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.34 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.25 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  51.96 
 
 		 213 aa  178  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  52.53 
 
 		 228 aa  177  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  52.82 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.73 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.76 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.96 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.42 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.78 
 
 		 234 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  50 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.8 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.47 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  47.21 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.06 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.74 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.48 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  45.36 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.99 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  44.39 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  44.39 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  43.88 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.98 
 
 		 211 aa  138  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  46.43 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.43 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.19 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.51 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.34 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  45.92 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  44.78 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.55 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.69 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  47.15 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  47.12 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  45.31 
 
 		 201 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.52 
 
 		 192 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.86 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  46.56 
 
 		 184 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  42.11 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  38.28 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.49 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  43.23 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  42.19 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.68 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  43.68 
 
 		 184 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.16 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.16 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  43.35 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.75 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.76 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  41.15 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.85 
 
 		 208 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  43.43 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.95 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.91 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.85 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  38.05 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  38.05 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  38.05 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  37.75 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  36.27 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  38.05 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.69 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  37.75 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.78 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.13 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  37.25 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  37.25 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.41 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  37.25 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.18 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  37.25 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  42.27 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.57 
 
 		 187 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.02 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.67 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.96 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  43 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  43 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.98 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  43 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  43.59 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  35.83 
 
 		 170 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.35 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  37.82 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  36.46 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.2 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  44.81 
 
 		 174 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.45 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.94 
 
 		 168 aa  105  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  34.01 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.84 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.92 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.07 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  36.26 
 
 		 189 aa  102  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  34.01 
 
 		 183 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  34.72 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  36.46 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.41 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>