153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2023 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  64.68 
 
 
228 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.87 
 
 
209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  55.26 
 
 
213 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  50.89 
 
 
206 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.1 
 
 
216 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  50.45 
 
 
212 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.77 
 
 
211 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.71 
 
 
230 aa  175  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  50.47 
 
 
197 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.27 
 
 
215 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.83 
 
 
216 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.96 
 
 
214 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.89 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.4 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.81 
 
 
226 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.05 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.23 
 
 
209 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.75 
 
 
212 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.89 
 
 
219 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  44.39 
 
 
207 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.54 
 
 
240 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  42.6 
 
 
207 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  45.16 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.45 
 
 
224 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  42.15 
 
 
207 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  42.15 
 
 
207 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.26 
 
 
219 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.79 
 
 
210 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  40.99 
 
 
201 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.99 
 
 
190 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.43 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.3 
 
 
195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  39.34 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  39.35 
 
 
224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  42.66 
 
 
203 aa  123  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  42.18 
 
 
185 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.65 
 
 
196 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  36.02 
 
 
193 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  37.33 
 
 
196 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.74 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.44 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.65 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.28 
 
 
208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  39.71 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.73 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.71 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.27 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  35.75 
 
 
208 aa  115  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.9 
 
 
199 aa  115  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.53 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.11 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.73 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.34 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.34 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.79 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  35.29 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  35.29 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  40.1 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  35.29 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  35.14 
 
 
217 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.28 
 
 
182 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.73 
 
 
189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  34.25 
 
 
205 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  34.7 
 
 
205 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  40.1 
 
 
184 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  34.25 
 
 
205 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  34.25 
 
 
205 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  41.58 
 
 
174 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  34.7 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.87 
 
 
187 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 
211 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.55 
 
 
216 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  35.45 
 
 
205 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.1 
 
 
207 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  35.06 
 
 
201 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.96 
 
 
196 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  36.19 
 
 
181 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.86 
 
 
198 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  33.18 
 
 
206 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.54 
 
 
168 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  34.48 
 
 
189 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  38.24 
 
 
204 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  38.24 
 
 
204 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  38.24 
 
 
203 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.34 
 
 
189 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  38.28 
 
 
184 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  32.88 
 
 
204 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  33.33 
 
 
204 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  36.32 
 
 
205 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.32 
 
 
197 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  27.93 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  27.93 
 
 
205 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  33.02 
 
 
203 aa  99  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  30.24 
 
 
180 aa  98.2  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  37.26 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.78 
 
 
190 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  31.73 
 
 
189 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.46 
 
 
210 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>