155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6283 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  62.78 
 
 		 193 aa  230  9e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  64.61 
 
 		 192 aa  228  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  62.57 
 
 		 206 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  61.14 
 
 		 185 aa  222  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  62.92 
 
 		 189 aa  220  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  60.67 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  61.36 
 
 		 189 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  61.24 
 
 		 224 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  58.43 
 
 		 202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  61.36 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  60.22 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  59.66 
 
 		 203 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.8 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  59.67 
 
 		 196 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  56.57 
 
 		 181 aa  211  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  57.39 
 
 		 189 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  57.39 
 
 		 189 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  58.01 
 
 		 206 aa  197  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  59.89 
 
 		 184 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  56.57 
 
 		 205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  56 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  58.19 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  56.5 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.46 
 
 		 192 aa  167  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.65 
 
 		 204 aa  155  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.76 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.25 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  46.24 
 
 		 207 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  46.24 
 
 		 207 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  46.2 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.22 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  45.7 
 
 		 207 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  47.85 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.39 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.49 
 
 		 216 aa  128  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  40.76 
 
 		 213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.55 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  45 
 
 		 199 aa  127  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.58 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  41.12 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.89 
 
 		 205 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.02 
 
 		 220 aa  124  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  44.63 
 
 		 197 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.89 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  43.78 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.2 
 
 		 216 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.29 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.41 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  43.18 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  43.18 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  43.18 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.27 
 
 		 212 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.86 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.77 
 
 		 190 aa  117  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.39 
 
 		 212 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.33 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.78 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.09 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.14 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.08 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.51 
 
 		 201 aa  114  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40.56 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 		 240 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  44.38 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.58 
 
 		 226 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  38.58 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  38.89 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.23 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  36.55 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  36.55 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  36.04 
 
 		 205 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  37.56 
 
 		 205 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  37.56 
 
 		 205 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  37.56 
 
 		 205 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  37.56 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.78 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  39.09 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  37.56 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  38.5 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.81 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.76 
 
 		 212 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.92 
 
 		 219 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  37.56 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.36 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.98 
 
 		 201 aa  104  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  43.75 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.78 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.89 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.25 
 
 		 213 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.94 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.85 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  36.72 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.64 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.43 
 
 		 262 aa  101  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  35.75 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.57 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  35.39 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.68 
 
 		 232 aa  99  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>