153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4972 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  85.92 
 
 		 213 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  62.44 
 
 		 212 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.12 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.6 
 
 		 205 aa  195  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.56 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.57 
 
 		 190 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.2 
 
 		 190 aa  128  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  38.07 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.58 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.66 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.06 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.57 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.17 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  41.57 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  40.23 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.13 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.02 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.81 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.84 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  39.89 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.69 
 
 		 196 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.48 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  38.8 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  38.8 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.16 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.67 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.67 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  38.04 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.71 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.25 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.64 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.07 
 
 		 189 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.22 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.61 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  38.28 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  31.5 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.36 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  31.98 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.07 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.76 
 
 		 187 aa  99  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.89 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.84 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.8 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  30.88 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.97 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.15 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  35.98 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.18 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  35.94 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  41.51 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.38 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  38.42 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.86 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  36.72 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  39.44 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  34.54 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  42.41 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  32.99 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.08 
 
 		 211 aa  92.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  34.54 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  34.02 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  34.54 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  34.54 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.82 
 
 		 216 aa  91.7  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.18 
 
 		 230 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  34.02 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  34.54 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  34.02 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  34.02 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  36.52 
 
 		 185 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  35.96 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.31 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  34.44 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 		 198 aa  88.2  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.68 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.41 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.76 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.87 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  35.8 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03131  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.57 
 
 		 189 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.61 
 
 		 186 aa  84.7  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1601  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.57 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0269163  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  33.16 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.88 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.16 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.52 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.53 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.32 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.55 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  37.41 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.67 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.27 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  32.47 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  31.43 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.84 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  38.92 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>