146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3021 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.85 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.43 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  54.74 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  50.24 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.71 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.28 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  51.2 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  55.05 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.24 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.91 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.89 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.24 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.17 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.74 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.16 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.22 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.51 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  50 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  47.74 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.55 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  48.37 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  48.37 
 
 		 207 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  47.83 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.7 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.92 
 
 		 240 aa  141  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  49.17 
 
 		 203 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.47 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.33 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  50.25 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.04 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  54.94 
 
 		 174 aa  134  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.01 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  45.08 
 
 		 206 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.79 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  46.33 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  46.2 
 
 		 208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.54 
 
 		 224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  45.11 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.96 
 
 		 192 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.94 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.7 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  44.63 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  44.27 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.7 
 
 		 189 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.38 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  46.99 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  46.99 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  46.99 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.5 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.69 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  43.82 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.68 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.14 
 
 		 203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  40 
 
 		 193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.07 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  42.7 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  44.07 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.55 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.09 
 
 		 189 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.09 
 
 		 189 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.64 
 
 		 203 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.41 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.32 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.5 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  42.31 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.68 
 
 		 201 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.25 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.53 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  40.88 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.81 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.76 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  40.45 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  35.68 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.51 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  38.62 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.72 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.31 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.89 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.06 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  38.76 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  41.28 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.29 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.99 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.93 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.86 
 
 		 210 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  44.52 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  35.9 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  35.9 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  36.9 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  35.9 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.41 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.39 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.1 
 
 		 194 aa  96.7  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  37.42 
 
 		 183 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  35.38 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  36.81 
 
 		 183 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  35.38 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.04 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.2 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>