144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2956 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  98.52 
 
 
203 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  76.26 
 
 
203 aa  298  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  72.41 
 
 
203 aa  270  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  76.3 
 
 
174 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  57.22 
 
 
195 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.97 
 
 
210 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.57 
 
 
212 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.55 
 
 
217 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.67 
 
 
230 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.94 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  43.41 
 
 
213 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  48.4 
 
 
197 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  48.24 
 
 
206 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  48.26 
 
 
224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.15 
 
 
216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.83 
 
 
209 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  47.46 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.74 
 
 
220 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  46.86 
 
 
201 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  43.5 
 
 
196 aa  134  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  43.24 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.13 
 
 
219 aa  131  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.99 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.45 
 
 
182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.51 
 
 
211 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  46.07 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  42.49 
 
 
228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  47.59 
 
 
202 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.12 
 
 
240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.27 
 
 
226 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.44 
 
 
192 aa  125  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.76 
 
 
216 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.17 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  45.45 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  45.45 
 
 
184 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.88 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  41.05 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  42.93 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.06 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.67 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.74 
 
 
224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  38.89 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  36.67 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.79 
 
 
219 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.75 
 
 
234 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  37.99 
 
 
207 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  38.83 
 
 
185 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.06 
 
 
205 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  39.78 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  39.78 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.91 
 
 
208 aa  101  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.91 
 
 
208 aa  101  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.36 
 
 
192 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.89 
 
 
196 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.36 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  38.67 
 
 
207 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
217 aa  98.6  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
205 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
205 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
205 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  35.5 
 
 
205 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  36.31 
 
 
181 aa  97.8  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.11 
 
 
210 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  38.17 
 
 
201 aa  97.1  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  34.34 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.38 
 
 
190 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.87 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.58 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.53 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  34 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.96 
 
 
187 aa  95.9  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  34.85 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  33.84 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.17 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.72 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.57 
 
 
189 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.57 
 
 
189 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.07 
 
 
189 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.54 
 
 
216 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.5 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.85 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.67 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.42 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.51 
 
 
206 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.3 
 
 
186 aa  91.3  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.77 
 
 
186 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.9 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.21 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.51 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  32.57 
 
 
180 aa  89  5e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.5 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  29.32 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.86 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.25 
 
 
232 aa  87.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  29.85 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>