156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0611 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 199 aa  408  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.64 
 
 		 192 aa  141  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  43.59 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.82 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  41.62 
 
 		 213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  42.42 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  39.8 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  40.21 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 		 192 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  45 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.5 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  42.16 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  41.31 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.3 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.75 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.7 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.96 
 
 		 192 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  42.86 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  40.1 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.34 
 
 		 189 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  39.2 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.59 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  39.2 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.67 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.5 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.1 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.5 
 
 		 189 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.5 
 
 		 189 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  41.03 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  38.16 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  41.75 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.81 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.76 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.85 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  38.24 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.18 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  38.38 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.5 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  37.98 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.5 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.64 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  37.86 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  37.86 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.37 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  37.86 
 
 		 205 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  38.65 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  38.89 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.7 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.09 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  38.65 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  37.38 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  40.72 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.69 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  38.05 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  38.16 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  38.92 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.31 
 
 		 220 aa  114  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.98 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.23 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  44.58 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.97 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  36.89 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  43.83 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  36.84 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.3 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  37.44 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  42.5 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  39.5 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.33 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  38.71 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.71 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  39.75 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.62 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.92 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  37.17 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.21 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.17 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.38 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.82 
 
 		 212 aa  104  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.27 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.3 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  36 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.77 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.98 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.6 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.54 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  36.32 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  37.7 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.19 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.3 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.1 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.62 
 
 		 234 aa  99.4  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.53 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.36 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.8 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.24 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  33 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  31.68 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  31.34 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03131  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.64 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>