155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2275 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  77.95 
 
 		 205 aa  299  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  57.29 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.41 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.8 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.31 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.55 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  44.62 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.7 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.69 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.98 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.89 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.67 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.36 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.9 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.42 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  41.29 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.56 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.1 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  40.76 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.84 
 
 		 204 aa  121  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  41.54 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  40.72 
 
 		 183 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.86 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.09 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.37 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  45.25 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.06 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.25 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  47.44 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  42.55 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.57 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.57 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  40.21 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.76 
 
 		 216 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.04 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.01 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.84 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  39.47 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  47.44 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  43.01 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  41.48 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  35.82 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  43.48 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  38.65 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  42.37 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  40.21 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  42.86 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.55 
 
 		 203 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.67 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.27 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.34 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.95 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  34.83 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  43.12 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.3 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  38.34 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.64 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.04 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.04 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.59 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  42.5 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  42.5 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  38.33 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  38.33 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  39.8 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.3 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.27 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.32 
 
 		 221 aa  101  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  39.79 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.92 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.33 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03131  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  36.87 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.07 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1601  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.59 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0269163  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.39 
 
 		 187 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.78 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.11 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.85 
 
 		 262 aa  94  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.67 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.45 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.57 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.06 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  37.84 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2368  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.02 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2414  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.02 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1660  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.41 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194559  normal  0.109762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  32.78 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.85 
 
 		 230 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  36.79 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.86 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.44 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02661  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.14 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.67 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1931  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.62 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.5 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  38.46 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.92 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.96 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>