155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1611 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 
198 aa  411  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.57 
 
 
201 aa  220  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.73 
 
 
209 aa  194  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  44 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.9 
 
 
198 aa  161  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  42 
 
 
205 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 
205 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.31 
 
 
197 aa  156  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  41.18 
 
 
205 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  41.58 
 
 
205 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  41.58 
 
 
205 aa  154  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  41.5 
 
 
205 aa  154  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  41 
 
 
205 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  41 
 
 
205 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  41 
 
 
205 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  41 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  41 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  40.5 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  41.18 
 
 
204 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.56 
 
 
190 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.82 
 
 
194 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.69 
 
 
210 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.66 
 
 
210 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.21 
 
 
207 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.9 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.34 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.97 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.89 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  40.53 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.86 
 
 
187 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  37.56 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.89 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  37.44 
 
 
224 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  38.78 
 
 
201 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.92 
 
 
186 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  37.11 
 
 
196 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  38.46 
 
 
206 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.09 
 
 
199 aa  121  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.09 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.59 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.08 
 
 
190 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3144  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.45 
 
 
193 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00878539  normal  0.470137 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  38.46 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.35 
 
 
186 aa  118  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.32 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.34 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  37.95 
 
 
183 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.04 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.13 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  36.27 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.18 
 
 
210 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.89 
 
 
182 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.04 
 
 
216 aa  111  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.47 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.72 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  35.9 
 
 
202 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0162  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.27 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.145239  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  34.83 
 
 
222 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1931  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.21 
 
 
205 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.16 
 
 
209 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.98 
 
 
208 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 
216 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  35.57 
 
 
184 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.11 
 
 
208 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  35.56 
 
 
193 aa  104  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.03 
 
 
222 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  31.28 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  31.28 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2368  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.21 
 
 
202 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2414  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.21 
 
 
202 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  31.28 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  31.28 
 
 
207 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  35.57 
 
 
206 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.51 
 
 
189 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  35.42 
 
 
184 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.67 
 
 
206 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.07 
 
 
212 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.71 
 
 
204 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.61 
 
 
205 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.82 
 
 
201 aa  101  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.05 
 
 
209 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  34.03 
 
 
184 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  34.01 
 
 
225 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  31.79 
 
 
258 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  35.71 
 
 
205 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.51 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  34.03 
 
 
185 aa  99  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.51 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  37.63 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  32.63 
 
 
213 aa  97.1  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  33.69 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.84 
 
 
224 aa  95.5  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0087  3-methyladenine DNA glycosylase  32.77 
 
 
189 aa  95.1  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0848019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.05 
 
 
213 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.5 
 
 
203 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0291  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.64 
 
 
226 aa  94  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.13 
 
 
195 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  35.48 
 
 
180 aa  93.6  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  37.1 
 
 
170 aa  93.6  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1601  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.43 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0269163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>