156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1635 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
190 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  62.57 
 
 
192 aa  234  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.45 
 
 
192 aa  203  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.03 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  50 
 
 
216 aa  184  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.92 
 
 
208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.26 
 
 
216 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.68 
 
 
204 aa  169  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  50.55 
 
 
206 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.11 
 
 
199 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  48.91 
 
 
224 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  49.48 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  49.73 
 
 
201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  45.1 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  47.94 
 
 
183 aa  161  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  45.83 
 
 
213 aa  160  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  45.21 
 
 
208 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  45.79 
 
 
207 aa  158  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  46.03 
 
 
196 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.7 
 
 
190 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  45.26 
 
 
207 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  45.26 
 
 
207 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.8 
 
 
189 aa  157  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.51 
 
 
205 aa  155  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  44.92 
 
 
203 aa  155  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  47.54 
 
 
202 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  44.74 
 
 
207 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  45.79 
 
 
258 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  43.09 
 
 
193 aa  153  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.65 
 
 
208 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.65 
 
 
208 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.79 
 
 
201 aa  151  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.28 
 
 
187 aa  151  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.16 
 
 
206 aa  150  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.64 
 
 
209 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.55 
 
 
206 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.05 
 
 
192 aa  148  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  44.56 
 
 
198 aa  148  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.88 
 
 
216 aa  147  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.24 
 
 
189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24181  3-methyladenine DNA glycosylase  41.03 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.15 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.76 
 
 
182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.3 
 
 
186 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.41 
 
 
201 aa  144  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.56 
 
 
186 aa  143  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  43.14 
 
 
205 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  45.36 
 
 
184 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  45.36 
 
 
184 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  42.55 
 
 
206 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  41.08 
 
 
185 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23941  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.59 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  42.08 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.93 
 
 
209 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.82 
 
 
207 aa  138  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  43.41 
 
 
205 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  43 
 
 
201 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.82 
 
 
199 aa  137  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.1 
 
 
196 aa  137  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  42.93 
 
 
184 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  42.16 
 
 
205 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0291  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.11 
 
 
226 aa  136  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  43.17 
 
 
205 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2052  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  39.69 
 
 
222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.74 
 
 
262 aa  134  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  45.76 
 
 
189 aa  132  3e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  41.06 
 
 
228 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.89 
 
 
203 aa  131  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.81 
 
 
213 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.04 
 
 
189 aa  130  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.04 
 
 
189 aa  130  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.05 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.22 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  40.86 
 
 
180 aa  127  8.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.05 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.69 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.05 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  42.79 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.7 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.58 
 
 
207 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.58 
 
 
216 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.96 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  41.79 
 
 
204 aa  124  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.98 
 
 
230 aa  124  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  41.58 
 
 
205 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  41.58 
 
 
205 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.44 
 
 
194 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  41.67 
 
 
205 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.69 
 
 
221 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02561  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.2 
 
 
187 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  43.1 
 
 
197 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.96 
 
 
215 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.9 
 
 
209 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.7 
 
 
220 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  41.09 
 
 
205 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  41.09 
 
 
205 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  41.09 
 
 
205 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  41.09 
 
 
205 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.17 
 
 
211 aa  121  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  41.09 
 
 
205 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>