154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2476 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 
197 aa  393  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  60.82 
 
 
213 aa  209  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  57.81 
 
 
209 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  57.14 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.71 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.94 
 
 
216 aa  195  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  54.41 
 
 
228 aa  188  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.73 
 
 
220 aa  187  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.86 
 
 
226 aa  184  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.56 
 
 
214 aa  184  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.38 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.33 
 
 
209 aa  177  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.61 
 
 
206 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.45 
 
 
212 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.87 
 
 
234 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.42 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.61 
 
 
219 aa  171  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.15 
 
 
212 aa  168  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  49.04 
 
 
224 aa  168  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  52.27 
 
 
207 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  51.69 
 
 
258 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.93 
 
 
211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  51.11 
 
 
207 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  51.11 
 
 
207 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.4 
 
 
240 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.5 
 
 
219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  50.56 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  49.49 
 
 
203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  55.36 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.31 
 
 
224 aa  151  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  47.37 
 
 
193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.1 
 
 
195 aa  141  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  44.97 
 
 
196 aa  141  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  46.07 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.43 
 
 
199 aa  139  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  44.32 
 
 
206 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  48.94 
 
 
204 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  48.94 
 
 
204 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  47.87 
 
 
203 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  48.4 
 
 
203 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  55.03 
 
 
174 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.63 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.1 
 
 
190 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.23 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.28 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  43.02 
 
 
208 aa  130  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.04 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.99 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.69 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  46.78 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  46.2 
 
 
184 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.3 
 
 
208 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.56 
 
 
203 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  42.61 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.3 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.93 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.93 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  42.51 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.8 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.53 
 
 
189 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 
205 aa  121  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 
205 aa  120  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.11 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  44.05 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  42.44 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.55 
 
 
187 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.56 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  40.33 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.94 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  36.18 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  36.68 
 
 
204 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.69 
 
 
194 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  43.89 
 
 
168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  42.05 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.07 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.07 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  39.57 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.07 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.57 
 
 
232 aa  108  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.52 
 
 
199 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.87 
 
 
203 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.49 
 
 
190 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  33.67 
 
 
204 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.49 
 
 
205 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.68 
 
 
197 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  36.67 
 
 
189 aa  105  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.82 
 
 
207 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.58 
 
 
211 aa  104  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.22 
 
 
206 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  39.78 
 
 
205 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 
217 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.84 
 
 
206 aa  101  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  36.36 
 
 
180 aa  101  7e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  38.6 
 
 
205 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>