155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1896 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
216 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  85.29 
 
 
220 aa  325  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.91 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  58.88 
 
 
213 aa  210  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  57.73 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  57.22 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  50.68 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  59.5 
 
 
197 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.76 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  53.77 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.27 
 
 
217 aa  177  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.03 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.88 
 
 
219 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.84 
 
 
234 aa  168  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.6 
 
 
209 aa  167  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.35 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  54.73 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  56.98 
 
 
211 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.26 
 
 
224 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  51.74 
 
 
219 aa  153  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.6 
 
 
240 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  53.93 
 
 
215 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  48.02 
 
 
193 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  51.25 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  51.25 
 
 
207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  45.9 
 
 
258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  49.39 
 
 
207 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.87 
 
 
212 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  50 
 
 
207 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.28 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  46.2 
 
 
203 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0157  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.47 
 
 
224 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.798535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2956  3-methyladenine DNA glycosylase  46.74 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3000  3-methyladenine DNA glycosylase  46.74 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.09 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2971  3-methyladenine DNA glycosylase  47.83 
 
 
203 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  hitchhiker  0.00962435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.67 
 
 
182 aa  128  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  47.7 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.99 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.88 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.58 
 
 
190 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  47.06 
 
 
203 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.336317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.12 
 
 
216 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  43.85 
 
 
205 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  46.07 
 
 
184 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.85 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  43.46 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  44.26 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  44.25 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.62 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  44.26 
 
 
185 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.32 
 
 
189 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  42.94 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01450  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.93 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  43.55 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  38 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  41.71 
 
 
181 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.21 
 
 
203 aa  115  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.21 
 
 
192 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  41.62 
 
 
196 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  42.62 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.76 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.69 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.9 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.02 
 
 
189 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.39 
 
 
203 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.02 
 
 
189 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.83 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.02 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3514  3-methyladenine DNA glycosylase  48.8 
 
 
174 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  43.1 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  38.62 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  43.68 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.95 
 
 
198 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.16 
 
 
208 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  38.38 
 
 
205 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.63 
 
 
208 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.01 
 
 
186 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  40.8 
 
 
202 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  38.38 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  37.88 
 
 
205 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.78 
 
 
192 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.54 
 
 
210 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.21 
 
 
201 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 
205 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 
205 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 
205 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.3 
 
 
197 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1657  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  41.48 
 
 
168 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.29752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 
205 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  47.54 
 
 
210 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 
205 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 
205 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  34.98 
 
 
204 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.94 
 
 
206 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  38.95 
 
 
170 aa  102  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.25 
 
 
186 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.9 
 
 
207 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  37.37 
 
 
204 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.36 
 
 
221 aa  101  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>