153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1801 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
210 aa  434  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0087  3-methyladenine DNA glycosylase  40.21 
 
 
189 aa  148  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0848019 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1931  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.79 
 
 
205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2368  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.3 
 
 
202 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2414  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.3 
 
 
202 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.19 
 
 
209 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  36.04 
 
 
205 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  34.18 
 
 
217 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  35.68 
 
 
205 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  35.78 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  35.78 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  35.78 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.36 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  36 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  36 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  35.78 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  36 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  36 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  35.78 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  36.18 
 
 
198 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  35 
 
 
204 aa  111  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.98 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  34.8 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.98 
 
 
190 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.26 
 
 
197 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.23 
 
 
192 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.65 
 
 
192 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.39 
 
 
262 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  37.89 
 
 
181 aa  98.2  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.41 
 
 
199 aa  98.2  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.98 
 
 
192 aa  97.8  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.6 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.6 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.95 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.95 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.46 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.45 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.27 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  33.51 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.67 
 
 
186 aa  94  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.64 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.18 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  36.41 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.83 
 
 
205 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.94 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  34.01 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.72 
 
 
196 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.36 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.63 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  36.46 
 
 
185 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  32.32 
 
 
196 aa  92  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  36.04 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  34.62 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  33.33 
 
 
206 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.63 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  32.16 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.96 
 
 
206 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.96 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.86 
 
 
211 aa  89  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.68 
 
 
210 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.01 
 
 
207 aa  88.6  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.07 
 
 
182 aa  87.8  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.22 
 
 
187 aa  88.2  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  31.94 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.17 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1660  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.43 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194559  normal  0.109762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.64 
 
 
210 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.28 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  31.98 
 
 
224 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.2 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.12 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.79 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  33.16 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.43 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.81 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.5 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  32.81 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.61 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.22 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.92 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  31.79 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0162  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.66 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.145239  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  40.31 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.14 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  31.37 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.17 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  30.85 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.48 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  30.85 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  32.28 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  29.9 
 
 
258 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.48 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.9 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  31.79 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  32.29 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  33.92 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.15 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  30.59 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0291  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.1 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>