134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0087 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0087  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0848019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.21 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2368  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.53 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2414  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.53 
 
 		 202 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1931  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.98 
 
 		 205 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.55 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  40.23 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  39.53 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  40.23 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  40.23 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  40.23 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  39.53 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  39.53 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  39.53 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.9 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  38.95 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  39.08 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  32.77 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.28 
 
 		 197 aa  94.4  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.43 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  37.21 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.07 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  36.42 
 
 		 258 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.51 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  34.04 
 
 		 217 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  38.92 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  37.29 
 
 		 206 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  32.26 
 
 		 205 aa  84.3  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  34.46 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.19 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  40.28 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  32.98 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.23 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.19 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  35.33 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.54 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2114  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.78 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.12 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.39 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.72 
 
 		 262 aa  80.9  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.82 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2104  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.78 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  34.78 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.15 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1660  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.36 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194559  normal  0.109762 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  33.15 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  34.94 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  34.94 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  34.94 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.76 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.94 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.48 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  32.39 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  33.74 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.54 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.22 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.15 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  30.3 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  33.74 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.94 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  33.73 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.54 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.54 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.34 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.95 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.54 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.32 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2679  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.97 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0045181  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  32.93 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.55 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.84 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.49 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  32.93 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  27.62 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  31.68 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.39 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.55 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  34 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0277  3-methyladenine DNA glycosylase  29.76 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  30.25 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.29 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  32.92 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.09 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1110  3-methyladenine DNA glycosylase  28 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.02 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.89 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.3 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.89 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.89 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  32.78 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.04 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.74 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.9 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  32.92 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.29 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  27.54 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  25.26 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  30.11 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>