152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1660 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1660  DNA-3-methyladenine glycosylase  100 
 
 
209 aa  414  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194559  normal  0.109762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.07 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.42 
 
 
192 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.17 
 
 
216 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.69 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  38.38 
 
 
193 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.65 
 
 
190 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  39 
 
 
207 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  39 
 
 
207 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  36.08 
 
 
207 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2580  3-methyladenine DNA glycosylase  32.02 
 
 
205 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.17 
 
 
198 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  32.09 
 
 
203 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  33.33 
 
 
205 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 
196 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  38.54 
 
 
207 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.11 
 
 
207 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  36.7 
 
 
258 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  35 
 
 
205 aa  99  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  35.82 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  35.82 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  35.82 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  35.82 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.79 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  31.37 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.44 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.58 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  35 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.92 
 
 
206 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.19 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  39.06 
 
 
224 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.88 
 
 
192 aa  95.9  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  34.33 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  34.33 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  34.33 
 
 
205 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  34.15 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  38.62 
 
 
184 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  35.32 
 
 
204 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1801  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.43 
 
 
210 aa  92  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.12 
 
 
197 aa  91.3  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  37.31 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.37 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.2 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  33.67 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  32.67 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  35.98 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.37 
 
 
262 aa  87.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.26 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  34.87 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7036  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0129343  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.23 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  33 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.16 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0319  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.73 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44968  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  34.17 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.84 
 
 
199 aa  85.5  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.71 
 
 
187 aa  85.1  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.65 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  37.7 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.92 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.44 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.13 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  35.75 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  35.2 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  33.64 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.82 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  37.7 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.49 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1931  DNA-3-methyladenine glycosylase  30.69 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0087  3-methyladenine DNA glycosylase  31.95 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0848019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2041  DNA-3-methyladenine glycosylase  33 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117286  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  34.17 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  32.98 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.2 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0428  DNA-3-methyladenine glycosylase  29.95 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.45136  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22240  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.47 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  31.82 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  34.39 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  36.27 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.94 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.16 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2363  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.17 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.701689  decreased coverage  0.00325367 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.54 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3243  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.92 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  30.96 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.68 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2004  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.22 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  36.31 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.66 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1678  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  34.36 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218414  normal  0.683693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.63 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.63 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.33 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.04 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2368  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.04 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2414  DNA-3-methyladenine glycosylase  28.04 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.46 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  32.97 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.51 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4972  DNA-3-methyladenine glycosylase  33.15 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537509  normal  0.124198 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>